Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC4Q9Y296 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms