Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHOC2Q9UQ13 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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