Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS5Q9UPZ3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms