Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PNMA8BQ9ULN7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNMA8BQ9ULN7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms