Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PALD1Q9ULE6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms