Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms