Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP21Q9UK80 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms