Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms