Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLCO3A1Q9UIG8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms