Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTNNA3Q9UI47 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms