Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SS18L2Q9UHA2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SS18L2Q9UHA2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms