Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms