Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD5Q9P267 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MBD5Q9P267 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms