Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC88CQ9P219 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms