Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms