Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4Q9P0V3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4Q9P0V3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms