Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EHD3Q9NZN3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms