Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXL2Q9NZ53 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms