Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms