Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms