Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC31BQ9NQW1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms