Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NRIP3Q9NQ35 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms