Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPJQ9HC77 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms