Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSPNQ9HAW4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms