Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NRDE2Q9H7Z3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms