Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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