Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms