Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms