Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCAPERQ9BY12 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAPERQ9BY12 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms