Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SNHG12Q9BXW3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms