Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THUMPD3Q9BV44 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms