Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms