Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCMBPQ9BTE3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCMBPQ9BTE3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms