Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C2orf88Q9BSF0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms