Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM83CQ9BQN1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM83CQ9BQN1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms