Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMSS1Q9BQ75 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms