Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCK3Q9BQ16 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCK3Q9BQ16 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms