Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms