Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1Q96NA8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms