Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EP400Q96L91 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms