Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRIQ1Q96JM4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRIQ1Q96JM4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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