Protein–RNA interactions for Protein: Q96J86

CYYR1, Cysteine and tyrosine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYYR1Q96J86 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYYR1Q96J86 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYYR1Q96J86 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms