Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPNQ96H22 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms