Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TIMD4Q96H15 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TIMD4Q96H15 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms