Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARF2Q96GP6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms