Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms