Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SMARCE1Q969G3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCE1Q969G3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms