Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
COPS9Q8WXC6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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