Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNAJA4Q8WW22 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms