Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRSK1Q8TDC3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms